Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNMO15061 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNMO15061 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNMO15061 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNMO15061 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNMO15061 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNMO15061 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNMO15061 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNMO15061 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNMO15061 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNMO15061 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNMO15061 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNMO15061 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNMO15061 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNMO15061 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNMO15061 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNMO15061 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNMO15061 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNMO15061 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNMO15061 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNMO15061 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNMO15061 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNMO15061 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNMO15061 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNMO15061 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNMO15061 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNMO15061 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNMO15061 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNMO15061 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNMO15061 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNMO15061 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNMO15061 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNMO15061 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNMO15061 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNMO15061 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNMO15061 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNMO15061 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNMO15061 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNMO15061 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNMO15061 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNMO15061 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNMO15061 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNMO15061 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNMO15061 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNMO15061 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNMO15061 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNMO15061 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNMO15061 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNMO15061 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNMO15061 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNMO15061 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNMO15061 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNMO15061 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNMO15061 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNMO15061 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNMO15061 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNMO15061 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNMO15061 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNMO15061 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNMO15061 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNMO15061 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNMO15061 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNMO15061 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNMO15061 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNMO15061 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNMO15061 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNMO15061 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNMO15061 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNMO15061 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNMO15061 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNMO15061 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNMO15061 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNMO15061 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNMO15061 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNMO15061 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNMO15061 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNMO15061 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNMO15061 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNMO15061 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNMO15061 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNMO15061 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNMO15061 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNMO15061 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNMO15061 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNMO15061 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNMO15061 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNMO15061 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNMO15061 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNMO15061 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNMO15061 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNMO15061 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNMO15061 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNMO15061 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNMO15061 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNMO15061 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNMO15061 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNMO15061 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNMO15061 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNMO15061 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNMO15061 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms