Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms