Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC78A2IDD5 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms