Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2F5

ICE1, Little elongation complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ICE1Q9Y2F5 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ICE1Q9Y2F5 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms