Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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