Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS29Q9UBQ0 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms