Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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RDH8Q9NYR8 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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RDH8Q9NYR8 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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RDH8Q9NYR8 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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RDH8Q9NYR8 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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RDH8Q9NYR8 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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RDH8Q9NYR8 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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RDH8Q9NYR8 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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