Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXK8

FBXL12, F-box/LRR-repeat protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL12Q9NXK8 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FBXL12Q9NXK8 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FBXL12Q9NXK8 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FBXL12Q9NXK8 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FBXL12Q9NXK8 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FBXL12Q9NXK8 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FBXL12Q9NXK8 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FBXL12Q9NXK8 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FBXL12Q9NXK8 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms