Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
STRN4Q9NRL3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRN4Q9NRL3 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms