Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI1

BRD7, Bromodomain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD7Q9NPI1 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRD7Q9NPI1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms