Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLSPNQ9HAW4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms