Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms