Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms