Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BBS2Q9BXC9 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms