Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC106Q9BWC9 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms