Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms