Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms