Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NEIL2Q969S2 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEIL2Q969S2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEIL2Q969S2 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NEIL2Q969S2 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEIL2Q969S2 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEIL2Q969S2 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEIL2Q969S2 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEIL2Q969S2 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEIL2Q969S2 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEIL2Q969S2 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEIL2Q969S2 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEIL2Q969S2 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms