Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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USP9XQ93008 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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USP9XQ93008 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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USP9XQ93008 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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USP9XQ93008 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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USP9XQ93008 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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USP9XQ93008 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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USP9XQ93008 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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USP9XQ93008 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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