Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKAP1Q86WV1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms