Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms