Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD2Q6Y1H2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms