Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms