Protein–RNA interactions for Protein: Q52LA3

LIN52, Protein lin-52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN52Q52LA3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIN52Q52LA3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms