Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
KRTAP20-2Q3LI61 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms