Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms