Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCK2Q16822 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCK2Q16822 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCK2Q16822 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCK2Q16822 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCK2Q16822 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCK2Q16822 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCK2Q16822 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCK2Q16822 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCK2Q16822 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCK2Q16822 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCK2Q16822 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCK2Q16822 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCK2Q16822 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCK2Q16822 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PCK2Q16822 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCK2Q16822 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCK2Q16822 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCK2Q16822 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCK2Q16822 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCK2Q16822 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCK2Q16822 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PCK2Q16822 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCK2Q16822 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PCK2Q16822 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCK2Q16822 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCK2Q16822 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PCK2Q16822 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCK2Q16822 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCK2Q16822 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCK2Q16822 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCK2Q16822 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCK2Q16822 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCK2Q16822 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCK2Q16822 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCK2Q16822 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCK2Q16822 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCK2Q16822 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PCK2Q16822 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCK2Q16822 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCK2Q16822 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCK2Q16822 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCK2Q16822 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCK2Q16822 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCK2Q16822 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCK2Q16822 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PCK2Q16822 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCK2Q16822 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCK2Q16822 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCK2Q16822 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCK2Q16822 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCK2Q16822 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCK2Q16822 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCK2Q16822 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCK2Q16822 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCK2Q16822 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCK2Q16822 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCK2Q16822 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PCK2Q16822 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCK2Q16822 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PCK2Q16822 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCK2Q16822 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCK2Q16822 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCK2Q16822 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCK2Q16822 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCK2Q16822 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCK2Q16822 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCK2Q16822 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCK2Q16822 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCK2Q16822 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCK2Q16822 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCK2Q16822 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCK2Q16822 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCK2Q16822 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCK2Q16822 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PCK2Q16822 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCK2Q16822 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCK2Q16822 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCK2Q16822 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCK2Q16822 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCK2Q16822 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCK2Q16822 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCK2Q16822 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PCK2Q16822 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PCK2Q16822 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCK2Q16822 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PCK2Q16822 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCK2Q16822 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCK2Q16822 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCK2Q16822 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PCK2Q16822 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCK2Q16822 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCK2Q16822 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCK2Q16822 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCK2Q16822 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCK2Q16822 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCK2Q16822 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCK2Q16822 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCK2Q16822 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCK2Q16822 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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