Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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