Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

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Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ZNF56Q15929 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ZNF56Q15929 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ZNF56Q15929 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ZNF56Q15929 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ZNF56Q15929 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ZNF56Q15929 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ZNF56Q15929 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ZNF56Q15929 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ZNF56Q15929 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ZNF56Q15929 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ZNF56Q15929 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ZNF56Q15929 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ZNF56Q15929 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
ZNF56Q15929 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ZNF56Q15929 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ZNF56Q15929 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ZNF56Q15929 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ZNF56Q15929 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ZNF56Q15929 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ZNF56Q15929 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ZNF56Q15929 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ZNF56Q15929 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
ZNF56Q15929 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
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ZNF56Q15929 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
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ZNF56Q15929 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
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ZNF56Q15929 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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ZNF56Q15929 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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