Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
EXOSC2Q13868 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms