Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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