Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BFSP2Q13515 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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