Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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