Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXF1Q12946 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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