Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20■□□□□ 0.79
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NFIAQ12857 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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NFIAQ12857 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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NFIAQ12857 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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NFIAQ12857 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
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NFIAQ12857 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC20■□□□□ 0.79
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NFIAQ12857 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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NFIAQ12857 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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NFIAQ12857 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NFIAQ12857 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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