Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TWF1Q12792 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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