Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms