Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSC1Q08554 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms