Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms