Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FMODQ06828 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FMODQ06828 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FMODQ06828 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FMODQ06828 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FMODQ06828 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FMODQ06828 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FMODQ06828 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FMODQ06828 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FMODQ06828 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FMODQ06828 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FMODQ06828 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FMODQ06828 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FMODQ06828 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FMODQ06828 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FMODQ06828 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FMODQ06828 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FMODQ06828 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FMODQ06828 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FMODQ06828 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FMODQ06828 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FMODQ06828 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FMODQ06828 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FMODQ06828 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FMODQ06828 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FMODQ06828 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FMODQ06828 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FMODQ06828 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FMODQ06828 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FMODQ06828 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FMODQ06828 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FMODQ06828 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FMODQ06828 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FMODQ06828 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FMODQ06828 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FMODQ06828 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FMODQ06828 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FMODQ06828 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FMODQ06828 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FMODQ06828 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FMODQ06828 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FMODQ06828 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FMODQ06828 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FMODQ06828 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FMODQ06828 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FMODQ06828 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FMODQ06828 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FMODQ06828 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FMODQ06828 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FMODQ06828 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FMODQ06828 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FMODQ06828 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FMODQ06828 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FMODQ06828 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FMODQ06828 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FMODQ06828 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FMODQ06828 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FMODQ06828 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FMODQ06828 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FMODQ06828 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FMODQ06828 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FMODQ06828 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FMODQ06828 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FMODQ06828 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FMODQ06828 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FMODQ06828 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FMODQ06828 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FMODQ06828 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FMODQ06828 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FMODQ06828 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FMODQ06828 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FMODQ06828 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FMODQ06828 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FMODQ06828 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FMODQ06828 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FMODQ06828 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FMODQ06828 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FMODQ06828 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FMODQ06828 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FMODQ06828 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FMODQ06828 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FMODQ06828 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FMODQ06828 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FMODQ06828 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FMODQ06828 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FMODQ06828 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FMODQ06828 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FMODQ06828 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FMODQ06828 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FMODQ06828 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FMODQ06828 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FMODQ06828 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FMODQ06828 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FMODQ06828 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FMODQ06828 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FMODQ06828 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FMODQ06828 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FMODQ06828 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FMODQ06828 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FMODQ06828 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms