Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms