Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms