Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MYBPC1Q00872 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms