Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
IRX1P78414 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRX1P78414 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRX1P78414 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRX1P78414 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRX1P78414 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRX1P78414 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRX1P78414 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRX1P78414 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRX1P78414 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRX1P78414 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRX1P78414 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRX1P78414 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRX1P78414 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IRX1P78414 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRX1P78414 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRX1P78414 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRX1P78414 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRX1P78414 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRX1P78414 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRX1P78414 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRX1P78414 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRX1P78414 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRX1P78414 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRX1P78414 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IRX1P78414 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRX1P78414 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRX1P78414 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRX1P78414 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRX1P78414 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRX1P78414 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRX1P78414 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRX1P78414 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRX1P78414 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRX1P78414 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IRX1P78414 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRX1P78414 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRX1P78414 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRX1P78414 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRX1P78414 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRX1P78414 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRX1P78414 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRX1P78414 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRX1P78414 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRX1P78414 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRX1P78414 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRX1P78414 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRX1P78414 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRX1P78414 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRX1P78414 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
IRX1P78414 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRX1P78414 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRX1P78414 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRX1P78414 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRX1P78414 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRX1P78414 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRX1P78414 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRX1P78414 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRX1P78414 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRX1P78414 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRX1P78414 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRX1P78414 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRX1P78414 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRX1P78414 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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IRX1P78414 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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IRX1P78414 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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IRX1P78414 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRX1P78414 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRX1P78414 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRX1P78414 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRX1P78414 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRX1P78414 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRX1P78414 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRX1P78414 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRX1P78414 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRX1P78414 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRX1P78414 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRX1P78414 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRX1P78414 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
IRX1P78414 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRX1P78414 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRX1P78414 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRX1P78414 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRX1P78414 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRX1P78414 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRX1P78414 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRX1P78414 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRX1P78414 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRX1P78414 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRX1P78414 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRX1P78414 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRX1P78414 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRX1P78414 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRX1P78414 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IRX1P78414 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRX1P78414 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRX1P78414 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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