Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IRX6P78412 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX6P78412 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX6P78412 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX6P78412 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX6P78412 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX6P78412 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX6P78412 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX6P78412 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX6P78412 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX6P78412 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX6P78412 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX6P78412 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX6P78412 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX6P78412 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX6P78412 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX6P78412 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX6P78412 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX6P78412 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX6P78412 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX6P78412 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX6P78412 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX6P78412 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX6P78412 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX6P78412 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX6P78412 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX6P78412 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX6P78412 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX6P78412 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX6P78412 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX6P78412 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX6P78412 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX6P78412 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX6P78412 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX6P78412 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX6P78412 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX6P78412 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX6P78412 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX6P78412 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX6P78412 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX6P78412 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX6P78412 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX6P78412 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX6P78412 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX6P78412 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX6P78412 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX6P78412 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX6P78412 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX6P78412 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX6P78412 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX6P78412 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX6P78412 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX6P78412 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX6P78412 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX6P78412 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX6P78412 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX6P78412 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX6P78412 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX6P78412 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX6P78412 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX6P78412 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX6P78412 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX6P78412 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX6P78412 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX6P78412 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX6P78412 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX6P78412 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX6P78412 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX6P78412 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX6P78412 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX6P78412 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX6P78412 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX6P78412 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX6P78412 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX6P78412 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX6P78412 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX6P78412 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX6P78412 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX6P78412 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX6P78412 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX6P78412 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX6P78412 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX6P78412 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX6P78412 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX6P78412 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX6P78412 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX6P78412 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX6P78412 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX6P78412 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX6P78412 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX6P78412 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX6P78412 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX6P78412 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX6P78412 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX6P78412 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX6P78412 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX6P78412 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX6P78412 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX6P78412 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX6P78412 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms