Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VBP1P61758 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VBP1P61758 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VBP1P61758 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VBP1P61758 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VBP1P61758 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VBP1P61758 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VBP1P61758 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VBP1P61758 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VBP1P61758 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VBP1P61758 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VBP1P61758 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VBP1P61758 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VBP1P61758 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VBP1P61758 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VBP1P61758 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VBP1P61758 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VBP1P61758 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VBP1P61758 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VBP1P61758 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VBP1P61758 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VBP1P61758 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VBP1P61758 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VBP1P61758 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VBP1P61758 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VBP1P61758 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VBP1P61758 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VBP1P61758 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VBP1P61758 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VBP1P61758 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VBP1P61758 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VBP1P61758 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VBP1P61758 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VBP1P61758 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VBP1P61758 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VBP1P61758 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VBP1P61758 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VBP1P61758 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VBP1P61758 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VBP1P61758 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VBP1P61758 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VBP1P61758 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VBP1P61758 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VBP1P61758 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VBP1P61758 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VBP1P61758 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VBP1P61758 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VBP1P61758 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VBP1P61758 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VBP1P61758 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VBP1P61758 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VBP1P61758 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VBP1P61758 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VBP1P61758 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VBP1P61758 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VBP1P61758 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VBP1P61758 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VBP1P61758 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VBP1P61758 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VBP1P61758 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VBP1P61758 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VBP1P61758 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VBP1P61758 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VBP1P61758 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VBP1P61758 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VBP1P61758 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VBP1P61758 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VBP1P61758 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VBP1P61758 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VBP1P61758 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VBP1P61758 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VBP1P61758 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VBP1P61758 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VBP1P61758 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VBP1P61758 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VBP1P61758 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VBP1P61758 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VBP1P61758 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VBP1P61758 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VBP1P61758 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VBP1P61758 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VBP1P61758 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VBP1P61758 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VBP1P61758 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VBP1P61758 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VBP1P61758 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VBP1P61758 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VBP1P61758 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VBP1P61758 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VBP1P61758 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VBP1P61758 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VBP1P61758 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VBP1P61758 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VBP1P61758 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VBP1P61758 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VBP1P61758 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VBP1P61758 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VBP1P61758 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VBP1P61758 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VBP1P61758 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms