Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 CMC2-201ENST00000219400 10301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 OPA3-201ENST00000263275 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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TMEM258P61165 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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TMEM258P61165 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 AC090114.2-201ENST00000608477 7054 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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TMEM258P61165 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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TMEM258P61165 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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TMEM258P61165 KDM5B-203ENST00000367265 10345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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TMEM258P61165 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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TMEM258P61165 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
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TMEM258P61165 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 PLEC-202ENST00000345136 14803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 TMEM120B-204ENST00000449592 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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