Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms