Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP9P55211 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP9P55211 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP9P55211 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP9P55211 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP9P55211 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP9P55211 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP9P55211 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP9P55211 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP9P55211 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP9P55211 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP9P55211 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP9P55211 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP9P55211 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP9P55211 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP9P55211 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP9P55211 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP9P55211 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP9P55211 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP9P55211 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP9P55211 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP9P55211 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP9P55211 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP9P55211 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP9P55211 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP9P55211 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP9P55211 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP9P55211 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP9P55211 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP9P55211 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP9P55211 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP9P55211 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP9P55211 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP9P55211 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP9P55211 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP9P55211 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP9P55211 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP9P55211 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP9P55211 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP9P55211 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP9P55211 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP9P55211 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP9P55211 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP9P55211 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP9P55211 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP9P55211 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP9P55211 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP9P55211 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP9P55211 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP9P55211 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP9P55211 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP9P55211 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP9P55211 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP9P55211 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP9P55211 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP9P55211 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP9P55211 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP9P55211 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP9P55211 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP9P55211 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP9P55211 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP9P55211 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP9P55211 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP9P55211 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP9P55211 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP9P55211 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP9P55211 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP9P55211 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP9P55211 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP9P55211 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP9P55211 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP9P55211 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP9P55211 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP9P55211 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP9P55211 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP9P55211 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP9P55211 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP9P55211 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP9P55211 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP9P55211 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP9P55211 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP9P55211 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP9P55211 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP9P55211 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP9P55211 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP9P55211 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP9P55211 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP9P55211 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP9P55211 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP9P55211 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP9P55211 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP9P55211 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP9P55211 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP9P55211 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP9P55211 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP9P55211 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP9P55211 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP9P55211 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP9P55211 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP9P55211 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms