Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms